Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BBS12Q6ZW61 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBS12Q6ZW61 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BBS12Q6ZW61 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBS12Q6ZW61 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS12Q6ZW61 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS12Q6ZW61 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS12Q6ZW61 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS12Q6ZW61 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS12Q6ZW61 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS12Q6ZW61 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBS12Q6ZW61 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBS12Q6ZW61 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BBS12Q6ZW61 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBS12Q6ZW61 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBS12Q6ZW61 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBS12Q6ZW61 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBS12Q6ZW61 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBS12Q6ZW61 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms