Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00299Q6ZSB3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00299Q6ZSB3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LINC00299Q6ZSB3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00299Q6ZSB3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms