Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSSK4Q6SA08 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSSK4Q6SA08 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSSK4Q6SA08 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSSK4Q6SA08 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSSK4Q6SA08 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSSK4Q6SA08 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms