Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A4Q6P1M0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A4Q6P1M0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A4Q6P1M0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC27A4Q6P1M0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms