Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL13AP3Q6NVV1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL13AP3Q6NVV1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL13AP3Q6NVV1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms