Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV0

FOXB2, Forkhead box protein B2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXB2Q5VYV0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXB2Q5VYV0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXB2Q5VYV0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXB2Q5VYV0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXB2Q5VYV0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXB2Q5VYV0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXB2Q5VYV0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXB2Q5VYV0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXB2Q5VYV0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXB2Q5VYV0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXB2Q5VYV0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXB2Q5VYV0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXB2Q5VYV0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms