Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCN1P1Q5VSP4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN1P1Q5VSP4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms