Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SOGA3Q5TF21 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SOGA3Q5TF21 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SOGA3Q5TF21 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms