Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMM23BQ5SRD1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TIMM23BQ5SRD1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMM23BQ5SRD1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMM23BQ5SRD1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMM23BQ5SRD1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMM23BQ5SRD1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMM23BQ5SRD1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMM23BQ5SRD1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TIMM23BQ5SRD1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMM23BQ5SRD1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMM23BQ5SRD1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TIMM23BQ5SRD1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMM23BQ5SRD1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TIMM23BQ5SRD1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TIMM23BQ5SRD1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TIMM23BQ5SRD1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms