Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAMD4BQ5PRF9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD4BQ5PRF9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD4BQ5PRF9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4BQ5PRF9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms