Protein–RNA interactions for Protein: Q1HG43

DUOXA1, Dual oxidase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOXA1Q1HG43 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DUOXA1Q1HG43 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUOXA1Q1HG43 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUOXA1Q1HG43 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUOXA1Q1HG43 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOXA1Q1HG43 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOXA1Q1HG43 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOXA1Q1HG43 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOXA1Q1HG43 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOXA1Q1HG43 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOXA1Q1HG43 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOXA1Q1HG43 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOXA1Q1HG43 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUOXA1Q1HG43 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOXA1Q1HG43 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOXA1Q1HG43 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOXA1Q1HG43 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUOXA1Q1HG43 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 686 ms