Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KNOP1Q1ED39 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KNOP1Q1ED39 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KNOP1Q1ED39 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KNOP1Q1ED39 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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