Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA1EQ15878 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA1EQ15878 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1EQ15878 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1EQ15878 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms