Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF1Q15637 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF1Q15637 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF1Q15637 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SF1Q15637 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF1Q15637 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF1Q15637 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF1Q15637 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF1Q15637 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SF1Q15637 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF1Q15637 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF1Q15637 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF1Q15637 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF1Q15637 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF1Q15637 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF1Q15637 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF1Q15637 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF1Q15637 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SF1Q15637 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF1Q15637 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF1Q15637 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF1Q15637 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF1Q15637 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SF1Q15637 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF1Q15637 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SF1Q15637 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF1Q15637 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SF1Q15637 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF1Q15637 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF1Q15637 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF1Q15637 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF1Q15637 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF1Q15637 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SF1Q15637 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF1Q15637 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SF1Q15637 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF1Q15637 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF1Q15637 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF1Q15637 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SF1Q15637 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF1Q15637 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SF1Q15637 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF1Q15637 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF1Q15637 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF1Q15637 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF1Q15637 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF1Q15637 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF1Q15637 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF1Q15637 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF1Q15637 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF1Q15637 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SF1Q15637 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF1Q15637 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF1Q15637 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF1Q15637 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF1Q15637 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SF1Q15637 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF1Q15637 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF1Q15637 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF1Q15637 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SF1Q15637 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF1Q15637 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF1Q15637 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF1Q15637 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF1Q15637 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SF1Q15637 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF1Q15637 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF1Q15637 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF1Q15637 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF1Q15637 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF1Q15637 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SF1Q15637 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SF1Q15637 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF1Q15637 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF1Q15637 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF1Q15637 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF1Q15637 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF1Q15637 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF1Q15637 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF1Q15637 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF1Q15637 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF1Q15637 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF1Q15637 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF1Q15637 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF1Q15637 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF1Q15637 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF1Q15637 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF1Q15637 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF1Q15637 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF1Q15637 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF1Q15637 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF1Q15637 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF1Q15637 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF1Q15637 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF1Q15637 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF1Q15637 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF1Q15637 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF1Q15637 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF1Q15637 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF1Q15637 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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