Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCEA2Q15560 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCEA2Q15560 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEA2Q15560 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCEA2Q15560 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
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