Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
EEA1Q15075 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
EEA1Q15075 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
EEA1Q15075 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
EEA1Q15075 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
EEA1Q15075 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.33■■■■■ 4.21
EEA1Q15075 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.33■■■■■ 4.21
EEA1Q15075 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
EEA1Q15075 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
EEA1Q15075 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC41.33■■■■■ 4.21
EEA1Q15075 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
EEA1Q15075 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
EEA1Q15075 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
EEA1Q15075 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC41.24■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC41.22■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
EEA1Q15075 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
EEA1Q15075 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
EEA1Q15075 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
EEA1Q15075 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
EEA1Q15075 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
EEA1Q15075 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
EEA1Q15075 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
EEA1Q15075 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
EEA1Q15075 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
EEA1Q15075 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
EEA1Q15075 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
EEA1Q15075 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
EEA1Q15075 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
EEA1Q15075 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
EEA1Q15075 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
EEA1Q15075 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
EEA1Q15075 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
EEA1Q15075 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
EEA1Q15075 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
EEA1Q15075 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
EEA1Q15075 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
EEA1Q15075 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
EEA1Q15075 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
EEA1Q15075 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
EEA1Q15075 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
EEA1Q15075 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
EEA1Q15075 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
EEA1Q15075 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC41.02■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
EEA1Q15075 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC41.01■■■■■ 4.15
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