Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE6HQ13956 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDE6HQ13956 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE6HQ13956 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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