Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H2Q13888 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H2Q13888 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H2Q13888 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H2Q13888 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H2Q13888 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2H2Q13888 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H2Q13888 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H2Q13888 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H2Q13888 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2H2Q13888 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H2Q13888 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2H2Q13888 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2H2Q13888 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H2Q13888 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H2Q13888 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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