Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MADCAM1Q13477 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MADCAM1Q13477 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MADCAM1Q13477 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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