Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MSLNQ13421 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSLNQ13421 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSLNQ13421 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSLNQ13421 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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