Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5R2Q13319 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5R2Q13319 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5R2Q13319 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDK5R2Q13319 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5R2Q13319 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5R2Q13319 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5R2Q13319 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5R2Q13319 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5R2Q13319 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDK5R2Q13319 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5R2Q13319 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK5R2Q13319 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5R2Q13319 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms