Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANK3Q12955 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANK3Q12955 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANK3Q12955 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANK3Q12955 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANK3Q12955 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANK3Q12955 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANK3Q12955 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANK3Q12955 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANK3Q12955 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANK3Q12955 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANK3Q12955 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANK3Q12955 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANK3Q12955 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ANK3Q12955 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANK3Q12955 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms