Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TGM3Q08188 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TGM3Q08188 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TGM3Q08188 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms