Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF9Q07011 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms