Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SOX4Q06945 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOX4Q06945 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX4Q06945 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SOX4Q06945 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SOX4Q06945 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms