Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PSME1Q06323 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PSME1Q06323 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PSME1Q06323 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms