Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNEQ04844 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNEQ04844 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNEQ04844 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNEQ04844 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms