Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB2Q03252 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMNB2Q03252 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNB2Q03252 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNB2Q03252 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms