Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL6Q02878 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL6Q02878 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL6Q02878 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL6Q02878 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL6Q02878 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL6Q02878 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL6Q02878 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL6Q02878 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL6Q02878 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL6Q02878 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL6Q02878 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL6Q02878 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL6Q02878 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL6Q02878 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL6Q02878 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms