Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1Q01196 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUNX1Q01196 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNX1Q01196 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms