Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK5Q00535 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK5Q00535 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5Q00535 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5Q00535 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms