Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED6P86452 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED6P86452 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED6P86452 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED6P86452 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms