Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P62891 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P62891 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P62891 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P62891 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P62891 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P62891 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P62891 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P62891 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P62891 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P62891 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL39P62891 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL39P62891 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P62891 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P62891 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P62891 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P62891 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P62891 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P62891 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P62891 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P62891 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P62891 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P62891 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P62891 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P62891 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P62891 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL39P62891 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL39P62891 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL39P62891 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL39P62891 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P62891 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P62891 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P62891 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P62891 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P62891 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P62891 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL39P62891 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P62891 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P62891 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P62891 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P62891 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL39P62891 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P62891 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P62891 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPL39P62891 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P62891 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P62891 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P62891 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P62891 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P62891 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P62891 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P62891 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL39P62891 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P62891 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P62891 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P62891 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P62891 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P62891 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL39P62891 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P62891 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P62891 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P62891 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P62891 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P62891 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P62891 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P62891 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL39P62891 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P62891 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P62891 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P62891 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P62891 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P62891 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL39P62891 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P62891 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P62891 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P62891 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL39P62891 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P62891 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P62891 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P62891 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P62891 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P62891 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P62891 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P62891 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL39P62891 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPL39P62891 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P62891 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P62891 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P62891 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P62891 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P62891 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL39P62891 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P62891 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P62891 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P62891 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P62891 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P62891 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P62891 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P62891 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL39P62891 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms