Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1CAP62136 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1CAP62136 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1CAP62136 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1CAP62136 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms