Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMFBP60983 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMFBP60983 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMFBP60983 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMFBP60983 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMFBP60983 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMFBP60983 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMFBP60983 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMFBP60983 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMFBP60983 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GMFBP60983 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GMFBP60983 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GMFBP60983 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GMFBP60983 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GMFBP60983 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GMFBP60983 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GMFBP60983 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GMFBP60983 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GMFBP60983 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GMFBP60983 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMFBP60983 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMFBP60983 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMFBP60983 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMFBP60983 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMFBP60983 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMFBP60983 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMFBP60983 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMFBP60983 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMFBP60983 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMFBP60983 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMFBP60983 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMFBP60983 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMFBP60983 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMFBP60983 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMFBP60983 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMFBP60983 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMFBP60983 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMFBP60983 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMFBP60983 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMFBP60983 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMFBP60983 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMFBP60983 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMFBP60983 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMFBP60983 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMFBP60983 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMFBP60983 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMFBP60983 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMFBP60983 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMFBP60983 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMFBP60983 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMFBP60983 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GMFBP60983 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMFBP60983 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMFBP60983 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMFBP60983 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GMFBP60983 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GMFBP60983 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMFBP60983 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMFBP60983 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMFBP60983 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMFBP60983 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMFBP60983 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMFBP60983 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMFBP60983 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMFBP60983 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMFBP60983 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMFBP60983 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMFBP60983 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMFBP60983 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMFBP60983 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMFBP60983 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMFBP60983 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMFBP60983 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMFBP60983 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMFBP60983 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMFBP60983 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMFBP60983 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMFBP60983 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GMFBP60983 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMFBP60983 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMFBP60983 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMFBP60983 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMFBP60983 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GMFBP60983 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMFBP60983 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMFBP60983 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMFBP60983 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMFBP60983 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMFBP60983 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMFBP60983 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMFBP60983 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMFBP60983 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMFBP60983 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMFBP60983 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMFBP60983 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMFBP60983 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMFBP60983 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMFBP60983 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMFBP60983 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMFBP60983 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms