Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAG2P55895 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAG2P55895 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAG2P55895 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAG2P55895 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAG2P55895 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAG2P55895 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAG2P55895 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAG2P55895 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAG2P55895 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAG2P55895 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAG2P55895 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAG2P55895 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAG2P55895 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAG2P55895 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAG2P55895 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAG2P55895 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAG2P55895 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAG2P55895 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAG2P55895 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAG2P55895 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAG2P55895 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAG2P55895 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAG2P55895 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAG2P55895 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAG2P55895 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAG2P55895 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAG2P55895 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAG2P55895 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAG2P55895 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAG2P55895 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAG2P55895 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAG2P55895 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAG2P55895 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAG2P55895 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAG2P55895 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAG2P55895 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAG2P55895 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAG2P55895 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAG2P55895 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAG2P55895 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAG2P55895 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAG2P55895 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAG2P55895 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAG2P55895 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAG2P55895 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAG2P55895 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAG2P55895 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAG2P55895 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAG2P55895 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAG2P55895 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAG2P55895 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAG2P55895 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAG2P55895 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAG2P55895 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAG2P55895 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAG2P55895 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAG2P55895 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAG2P55895 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAG2P55895 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAG2P55895 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAG2P55895 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAG2P55895 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAG2P55895 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAG2P55895 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAG2P55895 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAG2P55895 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAG2P55895 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAG2P55895 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAG2P55895 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAG2P55895 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAG2P55895 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAG2P55895 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAG2P55895 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAG2P55895 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAG2P55895 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAG2P55895 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAG2P55895 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAG2P55895 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAG2P55895 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAG2P55895 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAG2P55895 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAG2P55895 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAG2P55895 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAG2P55895 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAG2P55895 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAG2P55895 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAG2P55895 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAG2P55895 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAG2P55895 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAG2P55895 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAG2P55895 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAG2P55895 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAG2P55895 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAG2P55895 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAG2P55895 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAG2P55895 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAG2P55895 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAG2P55895 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAG2P55895 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms