Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD4P55036 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD4P55036 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMD4P55036 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMD4P55036 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms