Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC18A1P54219 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC18A1P54219 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC18A1P54219 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC18A1P54219 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms