Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARFIP1P53367 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARFIP1P53367 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFIP1P53367 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARFIP1P53367 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms