Protein–RNA interactions for Protein: P51685

CCR8, C-C chemokine receptor type 8, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR8P51685 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR8P51685 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR8P51685 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR8P51685 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR8P51685 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR8P51685 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR8P51685 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR8P51685 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR8P51685 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR8P51685 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR8P51685 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR8P51685 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR8P51685 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCR8P51685 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCR8P51685 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCR8P51685 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR8P51685 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR8P51685 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR8P51685 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR8P51685 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR8P51685 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR8P51685 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR8P51685 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR8P51685 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR8P51685 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR8P51685 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR8P51685 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR8P51685 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR8P51685 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR8P51685 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR8P51685 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR8P51685 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR8P51685 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR8P51685 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR8P51685 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR8P51685 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR8P51685 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR8P51685 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR8P51685 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR8P51685 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR8P51685 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR8P51685 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR8P51685 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR8P51685 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCR8P51685 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCR8P51685 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR8P51685 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR8P51685 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR8P51685 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR8P51685 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR8P51685 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR8P51685 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR8P51685 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR8P51685 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR8P51685 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR8P51685 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR8P51685 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR8P51685 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR8P51685 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR8P51685 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR8P51685 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR8P51685 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR8P51685 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR8P51685 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR8P51685 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR8P51685 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCR8P51685 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCR8P51685 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCR8P51685 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCR8P51685 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCR8P51685 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCR8P51685 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCR8P51685 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR8P51685 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR8P51685 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR8P51685 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR8P51685 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR8P51685 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR8P51685 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR8P51685 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR8P51685 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR8P51685 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR8P51685 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR8P51685 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCR8P51685 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms