Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABRB2P47870 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GABRB2P47870 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRB2P47870 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRB2P47870 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1300.9 ms