Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ETV4P43268 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ETV4P43268 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ETV4P43268 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ETV4P43268 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ETV4P43268 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ETV4P43268 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ETV4P43268 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ETV4P43268 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ETV4P43268 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ETV4P43268 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ETV4P43268 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ETV4P43268 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ETV4P43268 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ETV4P43268 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ETV4P43268 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ETV4P43268 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ETV4P43268 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ETV4P43268 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ETV4P43268 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ETV4P43268 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ETV4P43268 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ETV4P43268 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ETV4P43268 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ETV4P43268 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ETV4P43268 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ETV4P43268 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ETV4P43268 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ETV4P43268 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ETV4P43268 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ETV4P43268 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ETV4P43268 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ETV4P43268 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ETV4P43268 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ETV4P43268 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ETV4P43268 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ETV4P43268 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ETV4P43268 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ETV4P43268 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ETV4P43268 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ETV4P43268 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ETV4P43268 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ETV4P43268 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ETV4P43268 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ETV4P43268 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ETV4P43268 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ETV4P43268 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ETV4P43268 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ETV4P43268 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ETV4P43268 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ETV4P43268 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ETV4P43268 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ETV4P43268 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ETV4P43268 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ETV4P43268 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ETV4P43268 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ETV4P43268 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ETV4P43268 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ETV4P43268 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ETV4P43268 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ETV4P43268 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ETV4P43268 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ETV4P43268 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ETV4P43268 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ETV4P43268 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ETV4P43268 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ETV4P43268 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ETV4P43268 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ETV4P43268 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ETV4P43268 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ETV4P43268 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ETV4P43268 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ETV4P43268 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ETV4P43268 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ETV4P43268 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETV4P43268 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETV4P43268 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETV4P43268 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ETV4P43268 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETV4P43268 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETV4P43268 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ETV4P43268 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETV4P43268 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETV4P43268 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETV4P43268 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETV4P43268 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETV4P43268 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETV4P43268 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ETV4P43268 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ETV4P43268 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETV4P43268 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETV4P43268 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETV4P43268 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETV4P43268 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETV4P43268 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ETV4P43268 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ETV4P43268 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ETV4P43268 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ETV4P43268 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ETV4P43268 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms