Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCIP41743 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCIP41743 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCIP41743 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCIP41743 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCIP41743 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCIP41743 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCIP41743 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCIP41743 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCIP41743 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCIP41743 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCIP41743 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCIP41743 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKCIP41743 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCIP41743 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms