Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX19P40855 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX19P40855 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX19P40855 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX19P40855 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX19P40855 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX19P40855 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX19P40855 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX19P40855 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX19P40855 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX19P40855 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX19P40855 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX19P40855 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX19P40855 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX19P40855 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX19P40855 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX19P40855 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX19P40855 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX19P40855 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX19P40855 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX19P40855 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PEX19P40855 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX19P40855 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX19P40855 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX19P40855 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX19P40855 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX19P40855 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX19P40855 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX19P40855 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX19P40855 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX19P40855 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX19P40855 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX19P40855 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX19P40855 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX19P40855 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX19P40855 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX19P40855 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX19P40855 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX19P40855 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX19P40855 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX19P40855 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX19P40855 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX19P40855 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX19P40855 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX19P40855 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX19P40855 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX19P40855 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX19P40855 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX19P40855 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX19P40855 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX19P40855 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX19P40855 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX19P40855 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX19P40855 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX19P40855 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX19P40855 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX19P40855 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX19P40855 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX19P40855 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX19P40855 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX19P40855 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX19P40855 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX19P40855 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX19P40855 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX19P40855 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX19P40855 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX19P40855 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX19P40855 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX19P40855 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX19P40855 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX19P40855 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX19P40855 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX19P40855 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX19P40855 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX19P40855 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PEX19P40855 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX19P40855 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX19P40855 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX19P40855 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX19P40855 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX19P40855 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX19P40855 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX19P40855 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX19P40855 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX19P40855 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX19P40855 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX19P40855 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX19P40855 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX19P40855 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX19P40855 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX19P40855 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX19P40855 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX19P40855 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX19P40855 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX19P40855 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX19P40855 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX19P40855 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX19P40855 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX19P40855 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX19P40855 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms