Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ARL3P36405 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARL3P36405 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARL3P36405 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARL3P36405 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARL3P36405 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARL3P36405 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARL3P36405 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARL3P36405 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARL3P36405 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ARL3P36405 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ARL3P36405 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ARL3P36405 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARL3P36405 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARL3P36405 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARL3P36405 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARL3P36405 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARL3P36405 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARL3P36405 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARL3P36405 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARL3P36405 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARL3P36405 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARL3P36405 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARL3P36405 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARL3P36405 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARL3P36405 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARL3P36405 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARL3P36405 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARL3P36405 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARL3P36405 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARL3P36405 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARL3P36405 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARL3P36405 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARL3P36405 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARL3P36405 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARL3P36405 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARL3P36405 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARL3P36405 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARL3P36405 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL3P36405 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL3P36405 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL3P36405 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL3P36405 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL3P36405 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL3P36405 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL3P36405 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL3P36405 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL3P36405 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL3P36405 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL3P36405 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARL3P36405 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARL3P36405 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARL3P36405 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARL3P36405 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARL3P36405 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARL3P36405 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL3P36405 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL3P36405 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL3P36405 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL3P36405 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL3P36405 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL3P36405 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARL3P36405 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL3P36405 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL3P36405 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL3P36405 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL3P36405 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARL3P36405 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL3P36405 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL3P36405 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL3P36405 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL3P36405 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL3P36405 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL3P36405 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL3P36405 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL3P36405 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARL3P36405 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL3P36405 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL3P36405 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL3P36405 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL3P36405 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL3P36405 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL3P36405 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL3P36405 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARL3P36405 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms