Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
DDIT3P35638 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDIT3P35638 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
DDIT3P35638 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDIT3P35638 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms