Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC12P31275 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC12P31275 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC12P31275 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.3 ms