Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CLIP1P30622 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CLIP1P30622 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CLIP1P30622 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CLIP1P30622 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CLIP1P30622 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CLIP1P30622 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CLIP1P30622 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CLIP1P30622 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CLIP1P30622 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CLIP1P30622 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CLIP1P30622 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CLIP1P30622 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CLIP1P30622 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CLIP1P30622 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CLIP1P30622 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CLIP1P30622 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CLIP1P30622 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CLIP1P30622 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
CLIP1P30622 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CLIP1P30622 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CLIP1P30622 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
CLIP1P30622 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CLIP1P30622 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CLIP1P30622 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CLIP1P30622 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
CLIP1P30622 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
CLIP1P30622 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
CLIP1P30622 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CLIP1P30622 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
CLIP1P30622 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC40.05■■■■■ 4
CLIP1P30622 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
CLIP1P30622 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CLIP1P30622 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CLIP1P30622 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
CLIP1P30622 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CLIP1P30622 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
CLIP1P30622 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
CLIP1P30622 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CLIP1P30622 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
CLIP1P30622 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CLIP1P30622 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CLIP1P30622 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CLIP1P30622 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CLIP1P30622 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CLIP1P30622 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
CLIP1P30622 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CLIP1P30622 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CLIP1P30622 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CLIP1P30622 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC40■■■■□ 3.99
CLIP1P30622 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CLIP1P30622 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CLIP1P30622 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
CLIP1P30622 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CLIP1P30622 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CLIP1P30622 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CLIP1P30622 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
CLIP1P30622 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CLIP1P30622 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CLIP1P30622 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CLIP1P30622 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CLIP1P30622 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CLIP1P30622 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CLIP1P30622 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CLIP1P30622 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CLIP1P30622 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CLIP1P30622 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CLIP1P30622 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CLIP1P30622 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CLIP1P30622 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CLIP1P30622 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CLIP1P30622 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CLIP1P30622 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CLIP1P30622 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CLIP1P30622 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CLIP1P30622 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CLIP1P30622 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CLIP1P30622 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CLIP1P30622 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CLIP1P30622 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CLIP1P30622 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
CLIP1P30622 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
CLIP1P30622 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
CLIP1P30622 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.2 ms