Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-FP30511 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLA-FP30511 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HLA-FP30511 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-FP30511 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-FP30511 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms