Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
HMGB2P26583 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
HMGB2P26583 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGB2P26583 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HMGB2P26583 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms